MLK【numpy/scipyの設定】
本家はこちらです。インストールします。
MKLのインストール
$ sudo apt install -y wget apt-transport-https $ wget https://apt.repos.intel.com/intel-gpg-keys/GPG-PUB-KEY-INTEL-SW-PRODUCTS-2019.PUB $ sudo apt-key add GPG-PUB-KEY-INTEL-SW-PRODUCTS-2019.PUB $ sudo wget https://apt.repos.intel.com/setup/intelproducts.list -O /etc/apt/sources.list.d/intelproducts.list $ sudo apt update $ sudo apt install intel-mkl-20xx.x-xxx
仮想環境の設定
仮想環境で設定しました。詳細は別記事参照。
numpyの再コンパイル
~/.numpy-site.cfgを作成し、以下記載します。
[mkl] library_dirs = /opt/intel/mkl/lib/intel64/ include_dirs = /opt/intel/mkl/include mkl_libs = mkl_rt lapack_libs =
numpyでcythonが必要と怒られたので、cythonをインストールします。
(.venv) $pip install cython
mklを呼びたいので、下記コマンドでpipしておきます。
(.venv) $ pip install --no-binary :all: numpy (.venv) $ pip install --no-binary :all: scipy
インストールした後に一応確認します。
>>> import numpy as np >>> np.show_config()
mklの参照先が設定されていればok
mklに変えたことで計算速度が速くなるかどうかは未検証です。
参考にしました。
https://insilico-notebook.com/python-blas-performance/
Intel MKL を apt からインストールする - Qiita
